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全球癌症多體學的創新技術 Innovations in Global Multiomics Technologies for Cancer
2025/09/17
Frost & Sullivan
www.frost.com
一、前言
多體學(Multiomics)是指整合多層次生物分子資訊的科學方法,涵蓋基因體學(Genomics)、轉錄體學(Transcriptomics)、蛋白體學(Proteomics)、代謝體學(Metabolomics)及表觀基因體學(Epigenomics)等多種體學層面,透過整合這些層次的資料,研究者得以在系統層次上理解疾病的分子機制,了解細胞行為、信號網絡與病理變化的全貌。

在癌症研究與臨床應用中,多體學的興起已徹底改變了精準醫療的進程,傳統的單一體學分析(例如只分析DNA或蛋白質)往往無法全面顯示腫瘤的複雜性;而多體學方法能同時分析基因突變、RNA表現、蛋白修飾及代謝異常,為腫瘤異質性、免疫微環境以及治療反應提供更深入的洞察。

最新的多體學創新聚焦於單細胞層級的分析(Single-cell Multiomics)與AI整合的多體學分析平台,前者可顯示腫瘤內部細胞的演化與耐藥機制,後者則藉由人工智慧模型進行跨體學資料融合,提升預測與診斷精度

二、市場動態
多體學在癌症領域的崛起,受到多重因素推動,首先,跨體學整合的精準醫療發展持續成為主要動力,透過基因體、轉錄體與蛋白體資料的整合,研究者能更精確地分類癌症亞型、辨識致病突變,並設計針對性的治療策略,大型專案如The Cancer Genome Atlas (TCGA) 與 Pan-Cancer Atlas 建立了龐大的跨體學資料庫,為腫瘤研究與新藥開發提供關鍵依據。

其次,人工智慧與機器學習的導入,使多體學分析進入智慧化階段,AI技術可在龐雜的多體學資料中挖掘潛在模式,協助病人分層、預測治療反應與發掘生物標誌物,代表性企業如CytoReason、Owkin與Tempus,皆以 AI 演算法結合臨床資料,開發能支援臨床決策的多體學平台,顯著提升精準醫療的可操作性。

再者,單細胞與空間多體學技術的進步,單細胞分析能在個體細胞層級顯示腫瘤異質性與耐藥機制,而空間轉錄體與蛋白體技術則能在保留組織結構下描繪腫瘤微環境,這些高解析度工具正成為理解腫瘤進化與免疫互動的重要手段。

最後,價值導向醫療(Value-based Healthcare)的興起也推動多體學臨床應用擴張,隨著醫療支付與政策趨勢轉向強調療效與成本效益,能提供早期預測與個人化治療的多體學診斷方案,正逐步成為臨床決策的重要依據。

然而,市場仍存在多重挑戰:資料異質性與標準化不足是主要瓶頸,來自不同平台與實驗的資料格式差異,限制了跨體學整合與重現性。技術成本與基礎設施需求同樣構成障礙,多體學分析仰賴昂貴的儀器與質譜,以及強大的生物資訊運算能力,使低資源地區難以落實。臨床驗證與監管程序不足亦延緩了市場導入,目前大部分多體學檢測仍停留在研究階段,缺乏大型臨床試驗支撐,報銷與法規途徑尚未明確。整體而言,雖然挑戰存在,但隨著AI輔助分析、雲端運算及國際合作網絡的成熟,這些限制預期將逐步克服,為多體學市場帶來持續且可擴展的成長潛力。

三、創新技術
多體學技術的創新正快速推動癌症研究與臨床應用。其發展可歸納為三個主要方向:單細胞多體學、整合多體學,以及空間多體學;此外,人工智慧(AI)驅動的多體學應用則進一步提升了資料整合與臨床決策的深度。

(一)多體學在癌症治療的創新方法
1.單細胞多體學(Single-cell Multiomics)
單細胞多體學代表了腫瘤研究解析度的重大突破,過去傳統體學分析以樣本平均為基礎,往往掩蓋腫瘤細胞間的異質性,而單細胞多體學能在單一細胞層級同時測量DNA、RNA、蛋白質與表觀修飾,顯示腫瘤演化、耐藥性與免疫逃逸機制。此技術可精確追蹤腫瘤細胞譜系變化與少數抗藥亞群,並協助臨床進行更準確的病人分層,例如,Mission Bio 的 Tapestri® 平台可同時偵測單細胞DNA與蛋白表現,應用於急性骨髓性白血病及實體瘤的殘餘疾病監測;10x Genomics 的 Chromium X 可同步進行RNA與ATAC-seq 分析,揭示基因表現與染色質開放狀態;而 Parse Biosciences 的 Evercode 技術則使單細胞多體學可擴展至百萬細胞規模。

2.整合多體學(Integrated Multiomics)
整合多體學透過基因體、轉錄體、蛋白體與代謝體資料的交叉驗證,研究者得以從多層次視角理解腫瘤的分子運作與治療反應,例如,在乳癌研究中,Thermo Fisher Scientific 與 Natera 結合蛋白體與基因體技術,開發出能監測微量殘餘疾病(Minimal Residual Disease, MRD)的液體活檢工具;在大腸癌領域,Exact Sciences與Freenome整合甲基化與腸道微生物體資料,強化早期診斷能力;而在膠質母細胞瘤與黑色素瘤研究中,結合空間轉錄體與磷酸蛋白體的分析,已能顯示免疫治療反應與腫瘤微環境互動的分子基礎。

3. 空間多體學(Spatial Multiomics)
空間多體學可在保留組織結構的情況下,同步分析基因、蛋白質及代謝物的分佈,建立細胞與其空間位置之間的分子地圖,代表技術如 NanoString CosMx、Akoya PhenoCycler®/PhenoImager® 以及 Vizgen MERSCOPE®,可在亞細胞層級同時觀測上千種分子標記,並以高解析度呈現免疫細胞分佈與腫瘤細胞互動,這些成果對免疫治療研究具有重大意義,因其揭示了腫瘤中免疫逃逸與耐藥形成的空間動態。

(二)AI驅動的多體學應用與發展趨勢
隨著多體學資料規模呈指數級增長,人工智慧與機器學習成為不可或缺的分析核心,由於多體學資料維度高且具高度異質性,AI能協助整合並發掘潛在生物模式,其應用包括:(1)監督式學習: 利用已標記臨床資料預測癌症預後; (2)非監督式學習:自動辨識未知腫瘤亞型; (3)深度神經網路(Deep Neural Networks, DNNs): 融合影像與臨床資料找出預測性特徵; (4) 圖神經網路(Graph Neural Networks, GNNs): 模擬基因-蛋白-代謝物交互網路; (5) 聯邦學習(Federated Learning): 在不同醫療機構間進行隱私保護的模型訓練。

近期發展亮點包括:AI模型如OmicsCL、LASSO-MOGAT與 HeteroGATomics,透過對比學習與圖注意力網絡(Graph Attention Networks),能同時處理DNA甲基化、miRNA與蛋白互作網絡,顯著提升腫瘤分類準確度;AI 的臨床應用也在快速擴展,例如,Dxcover 的 Panoramic MOSATM 結合紅外光譜與AI演算法,可從血清樣本中偵測多種早期癌症;miONCO-Dx 則透過AI分析 microRNA 資料,在臨床試驗中達到近99%的診斷準確率;此外,Quibim QP-Insights®平台整合影像與多體學資料,利用AI進行放射基因體分析(Radiogenomics),支援個別化治療決策;而 Nucleai ATOM 平台則結合空間蛋白體與深度學習,用於免疫治療反應預測;在研發領域,AI 亦推動多體學進入藥物開發與臨床預測新階段;BioAro的PanOmiQ平台結合基因體、蛋白體與微生物體資料,支援多語系臨床報告與即時數據整合;ProCanFDL 聯邦學習計畫則實現跨國資料共享,在保護隱私的前提下整合來自八個國家的蛋白質體資料,用於建立癌症亞型預測模型。AI與多體學的融合,正推動從資料生成到臨床應用的完整循環,使精準腫瘤醫學更具即時性與可擴展性。

四、多體學的合作概況與區域趨勢
多體學的發展已逐漸從單一機構的努力,轉變為跨產業、跨國界的合作生態系,隨著研究成本高昂與資料整合需求增加,企業、學術機構與政府單位間的策略夥伴關係,將成為推動創新與臨床應用的重要力量。以下介紹三項代表性案例:

(一)Thermo Fisher Scientific 與 Akoya Biosciences(2024)的合作為多體學跨界整合,雙方共同開發整合蛋白與RNA分析的空間多體學影像解決方案,結合 Akoya的 PhenoImager® 高解析度空間生物平台與Thermo Fisher的臨床研究網絡,使多體學從研究逐步延伸至臨床轉譯應用,此合作的重點在於建立標準化影像流程與共同授權模式,讓空間體學技術能更廣泛地應用於癌症診斷與病理研究。

(二)Bruker Corporation與Biognosys(2023)的合作展現了蛋白體學與質譜技術融合的潛力,Bruker將timsTOF 質譜平台與 Spectronaut® 定量蛋白體分析軟體結合,提升了蛋白質體研究的能力,這項合作不僅強化了藥物開發中的標誌物分析能力,也推進了整合蛋白體學於臨床檢測的實際應用。

(三)Becton Dickinson與Hamilton Company(2024)合作聯手開發可自動化操作的單細胞多體學試劑與工作流程,利用 BD Rhapsody 平台與 Hamilton 的 NGS STAR 機械系統實現高通量處理,顯著減少人為誤差並提升實驗可重現性,這種結合自動化、數位化與多體學的合作模式,預示了實驗室向臨床級應用轉化的趨勢。

在區域趨勢方面,北美以完整的科研與臨床生態系居全球領先,美國國家衛生研究院(National Institutes of Health, NIH)投資逾 5 億美元推動多體學研究,使其在癌症偵測與藥物反應預測上處於優勢;歐洲透過 Genome UK 與 Genomic Medicine Plan 2025 等政策推廣多體學常規化應用,並以 GDPR 架構促進跨國資料共享與聯邦學習;亞太地區則以中國、新加坡、印度為代表,重點發展臨床應用與液體活檢,多體學市場快速擴張; 中東地區如阿聯酋與以色列,也藉由國家級基因計畫與AI平台建立精準醫療基礎。整體而言,全球多體學合作正形成以「北美創新、歐洲整合、亞太落地」為核心的格局。各地在技術研發、臨床轉譯與數據治理上的互補發展,正推動多體學由實驗室走向臨床,成為全球癌症診斷與治療的重要驅動力量。

五、成長機會
未來多體學的成長將以臨床轉譯與商業化落地為核心,並圍繞「資料整合、臨床應用、跨域合作」三大方向展開。

首先,AI驅動的資料整合與臨床決策支持將是市場最主要的增長引擎,隨著多體學資料量急遽上升,AI與雲端運算能加速跨體學分析與臨床預測模型建立,推動早期診斷、藥物反應預測與精準治療落地,未來的關鍵不僅在技術突破,更在於臨床可用性與醫療報銷體系的完善。

其次,多體學臨床應用的標準化與自動化將帶來新商機,從樣本處理到資料解讀,流程自動化與演算法驗證將決定技術能否規模化導入醫院與檢測中心,整合影像、生物標誌與臨床資訊的多體學平台,將逐步取代傳統單一檢測模式。

最後,跨產業與跨國合作將成為推動創新的關鍵力量,學研機構、製藥公司與科技企業正形成以資料共享與AI分析為核心的合作網絡,推動多體學由研究走向臨床。隨著監管框架與隱私保護標準的明確化,這些合作將進一步提升多體學的臨床滲透率與全球市場價值。

綜觀而言,多體學的下一階段成長不再僅仰賴技術創新,而是來自臨床整合、數據治理與產業協作的全面成熟,象徵癌症精準醫療正邁向可持續發展的新階段。
林鈺喬
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